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Journal articles
UMI-Gen: A UMI-based read simulator for variant calling evaluation in paired-end sequencing NGS libraries
Vincent Sater
1
Pierre-Julien Viailly
2
Thierry Lecroq
1
Philippe Ruminy
2
Caroline Bérard
1
Élise Prieur-Gaston
1
Fabrice Jardin
2
1
TIBS - LITIS - Equipe Traitement de l'information en Biologie Santé
LITIS - Laboratoire d'Informatique, de Traitement de l'Information et des Systèmes
Vincent Sater 1
Author
Pierre-Julien Viailly 2
Author
Thierry Lecroq 1
Author IdHAL : thierry-lecroq ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1900-3397
Philippe Ruminy 2
Author
1
TIBS - LITIS - Equipe Traitement de l'information en Biologie Santé (France)
- LITIS - Laboratoire d'Informatique, de Traitement de l'Information et des Systèmes (Avenue de l'Université 76800 Saint-Étienne-du-Rouvray - France)
- INSA Rouen Normandie - Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (Avenue de l’Université 76801 Saint-Étienne-du-Rouvray Cedex - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- UNIROUEN - Université de Rouen Normandie : EA4108 (1, rue Thomas Becket 76821 Mont-Saint-Aignan Cedex - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- ULH - Université Le Havre Normandie (25 rue Philippe Lebon - BP 1123 - 76063 Le Havre Cedex France - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- INSA Rouen Normandie - Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (Avenue de l’Université 76801 Saint-Étienne-du-Rouvray Cedex - France)
2
GPMCND - Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques (22, Boulevard Gambetta 76183 Rouen Cedex - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1245 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- UNIROUEN - Université de Rouen Normandie (1, rue Thomas Becket 76821 Mont-Saint-Aignan Cedex - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
Document type :
Journal articles
Domain :
Complete list of metadata
https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03210438
Contributor : Thierry Lecroq Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Tuesday, April 27, 2021 - 10:31:38 PM
Last modification on : Friday, March 11, 2022 - 6:14:02 PM
Contributor : Thierry Lecroq Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Tuesday, April 27, 2021 - 10:31:38 PM
Last modification on : Friday, March 11, 2022 - 6:14:02 PM
Links full text
Identifiers
- HAL Id : hal-03210438, version 1
- DOI : 10.1016/j.csbj.2020.08.011
- PUBMEDCENTRAL : PMC7484502
Collections
CNRS | LITIS | INSA-ROUEN | UNIROUEN | INSA-GROUPE | GPMCND | COMUE-NORMANDIE | UNILEHAVRE | INSERM
Citation
Vincent Sater, Pierre-Julien Viailly, Thierry Lecroq, Philippe Ruminy, Caroline Bérard, et al.. UMI-Gen: A UMI-based read simulator for variant calling evaluation in paired-end sequencing NGS libraries. Computational and Structural Biotechnology Journal, Elsevier, 2020, 18, pp.2270-2280. ⟨10.1016/j.csbj.2020.08.011⟩. ⟨hal-03210438⟩
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