UMI-Gen: A UMI-based read simulator for variant calling evaluation in paired-end sequencing NGS libraries

Vincent Sater (1) , Pierre-Julien Viailly (2) , Thierry Lecroq (1) , Philippe Ruminy (2) , Caroline Bérard (1) , Élise Prieur-Gaston (1) , Fabrice Jardin (2)

1 TIBS - LITIS - Equipe Traitement de l'information en Biologie Santé
2 GPMCND - Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques

Domains: Computer Science [cs]; Bioinformatics [q-bio.QM]

Vincent Sater, Pierre-Julien Viailly, Thierry Lecroq, Philippe Ruminy, Caroline Bérard, et al.. UMI-Gen: A UMI-based read simulator for variant calling evaluation in paired-end sequencing NGS libraries. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2020, 18, pp.2270-2280. ⟨10.1016/j.csbj.2020.08.011⟩. ⟨hal-03210438⟩