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HAL-CNRSCNRS scientific publications |
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Chromosomal resolution reveals symbiotic virus colonization of parasitic wasp genomes
Jérémy Gauthier
1
Hélène Boulain
Joke J.F.A. van Vugt
Lyam Baudry
Emma Persyn
Jean-Marc Aury
Benjamin Noel
Anthony Bretaudeau
Fabrice Legeai
Sven Warris
Mohamed Amine Chebbi
Géraldine Dubreuil
Bernard Duvic
Natacha Kremer
Philippe Gayral
1
Karine Musset
1
Thibaut Josse
1
Diane Bigot
Christophe Bressac
1
Sébastien Moreau
1
Georges Periquet
Myriam Harry
2
Nicolas Montagne
3
Isabelle Boulogne
Mahnaz Sabeti-Azad
Martine Maïbèche
3
Thomas Chertemps
Frédérique Hilliou
4
David Siaussat
3
Joëlle Amselem
Isabelle Luyten
Claire Capdevielle-Dulac
2
Karine Labadie
Bruna Laís Merlin
Valérie Barbe
5
Jetske de Boer
Martial Marbouty
Fernando Luis Cônsoli
Stéphane Dupas
2
Aurélie Hua Van
2
Gaëlle Le Goff
4
Annie Bézier
1
Emmanuelle Jacquin-Joly
3
James Whitfield
Louise E.M. Vet
6
Hans Smid
Laure Kaiser
2
Romain Koszul
Elisabeth Huguet
1
Elisabeth Herniou
1
Jean-Michel Drezen
1
Emma Persyn
Author
Jean-Marc Aury
Author
Benjamin Noel
Author
Anthony Bretaudeau
Author IdHAL : anthony-bretaudeau
Fabrice Legeai
Author
Sven Warris
Author
Mohamed Amine Chebbi
Author
Géraldine Dubreuil
Author IdHAL : geraldine-dubreuil ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/N-4483-2013 IdRef : https://www.idref.fr/120030438 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-5410-8776
Bernard Duvic
Author IdHAL : bernard-duvic ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7618-7719
Natacha Kremer
Author IdHAL : nkremer ORCID : https://orcid.org/0000-0001-5678-9416
Philippe Gayral 1
Author
Karine Musset 1
Author
Thibaut Josse 1
Author
Diane Bigot
Author
Christophe Bressac 1
Author IdHAL : christophe-bressac ORCID : https://orcid.org/0000-0001-7609-8970
Sébastien Moreau 1
Author IdHAL : sebastien-moreau ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7796-310X
Georges Periquet
Author
Myriam Harry 2
Author
Nicolas Montagne 3
Author Employer institution : École des Ponts ParisTech IdHAL : nicolas-montagne ORCID : https://orcid.org/0000-0002-2322-7051
Isabelle Boulogne
Author IdHAL : isabelle-boulogne ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/N-5972-2014 ORCID : https://orcid.org/0000-0001-6810-6504
Mahnaz Sabeti-Azad
Author
Martine Maïbèche 3
Author
Thomas Chertemps
Author
Frédérique Hilliou 4
Author
David Siaussat 3
Author
Joëlle Amselem
Author
Isabelle Luyten
Author
Claire Capdevielle-Dulac 2
Author
Martial Marbouty
Author IdHAL : martial-marbouty ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1668-8423
Fernando Luis Cônsoli
Author
Stéphane Dupas 2
Author
Aurélie Hua Van 2
Author
Gaëlle Le Goff 4
Author
Annie Bézier 1
Author IdHAL : annie-bezier ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/B-4429-2016 IdRef : https://www.idref.fr/071600698 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-2528-4260
Emmanuelle Jacquin-Joly 3
Author IdHAL : emmanuelle-joly ORCID : https://orcid.org/0000-0002-6904-2036
James Whitfield
Author
Louise E.M. Vet 6
Author
Hans Smid
Author
Laure Kaiser 2
Author
Romain Koszul
Author IdHAL : romain-koszul ORCID : https://orcid.org/0000-0002-3086-1173
Elisabeth Huguet 1
Author IdHAL : elisabeth-huguet IdRef : https://www.idref.fr/110764358 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-0096-0330
Elisabeth A. Herniou 1
Author IdHAL : elisabeth-herniou ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/B-3786-2016 IdRef : https://www.idref.fr/164961615 ORCID : https://orcid.org/0000-0001-5362-6056
Jean-Michel Drezen 1
Author IdHAL : jean-michel-drezen IdRef : https://www.idref.fr/110764056 ORCID : https://orcid.org/0000-0001-7578-635X
1
IRBI - Institut de recherche sur la biologie de l'insecte UMR7261 (Av Monge 37200 TOURS - France)
- Université de Tours (60 rue du Plat d'Étain, 37020 Tours cedex 1 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7261 (France)
2
EGCE - Evolution, génomes, comportement et écologie (Avenue de la Terrasse, bâtiment 13, boite postale 1, 91198, Gif-sur-Yvette cedex - France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 9191 (France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
3
IEES (UMR_7618 / UMR_D_242 / UMR_A_1392 / UM_113) - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (Sorbonne-Université, campus de Jussieu - Bât A - Paris (75005)
Sorbonne-Université, campus de Jussieu - Tour 56/66 - Paris (75005)
AgroParisTech-INRA - Grignon (78)
INRA - Versailles (78)
IRD - Bondy (93)
UPEC - Créteil (94)
- France)
- INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement : UMR_A_1392 (France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR_7618 (France)
- UPEC UP12 - Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 : UMR_7618 (61 avenue du Général de Gaulle - 94010 Créteil cedex - France)
- SU - Sorbonne Université : UM_113 (21 rue de l’École de médecine - 75006 Paris - France)
- UP - Université de Paris (85 boulevard Saint-Germain 75006 Paris - France)
4
ISA - Institut Sophia Agrobiotech (INRAE Centre de recherche Provence-Alpes-Côte d'Azur 400, route des Chappes BP 167 06903 Sophia Antipolis Cedex - France)
- UNS - Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (Parc Valrose - BP 2135 - 06103 Nice cedex 2 - France)
- COMUE UCA - COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (Parc Valrose, 28 avenue Valrose 06108 Nice Cedex 2 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7254 (France)
- INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement : UMR1355 (France)
- UCA - Université Côte d'Azur (Parc Valrose, 28 avenue Valrose 06108 Nice Cedex 2 - France)
5
UMS 3628 - France Génomique (France Génomique
DSV/CEA/Genoscope
2, rue Gaston Crémieux
CP5706
91 057 Evry Cedex - France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives : DRF (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMS 3628 (France)
- INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (France)
Abstract : Most endogenous viruses, an important proportion of eukaryote genomes, are doomed to slowly decay. Little is known, however, on how they evolve when they confer a benefit to their host. Bracoviruses are essential for the parasitism success of parasitoid wasps, whose genomes they integrated ~103 million years ago. Here we show, from the assembly of a parasitoid wasp genome, for the first time at a chromosomal scale, that symbiotic bracovirus genes spread to and colonized all the chromosomes. Moreover, large viral clusters are stably maintained suggesting strong evolutionary constraints. Genomic comparison with another wasps revealed that this organization was already established ~53 mya. Transcriptomic analyses highlight temporal synchronization of viral gene expression, leading to particle production. Immune genes are not induced, however, indicating the virus is not perceived as foreign by the wasp. This recognition suggests that no conflicts remain between symbiotic partners when benefits to them converge.
Document type :
Preprints, Working Papers, ...
Domain :
Complete list of metadatas
https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03090838
Contributor : Laure Kaiser-Arnauld <>
Submitted on : Wednesday, December 30, 2020 - 10:56:12 AM
Last modification on : Wednesday, January 6, 2021 - 3:43:21 AM
Contributor : Laure Kaiser-Arnauld <>
Submitted on : Wednesday, December 30, 2020 - 10:56:12 AM
Last modification on : Wednesday, January 6, 2021 - 3:43:21 AM
File
Gauthier et al_Cotesia genomes...
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Identifiers
- HAL Id : hal-03090838, version 1
- DOI : 10.1101/2020.03.19.994459
Collections
CNRS | UPEC-UPEM | UPEC | CEA | CEA-UPSAY | UNICE | UNIV-COTEDAZUR | UNIV-TOURS | IEES | INRAE | IRBI | UP-SCIENCES | IRD | SORBONNE-UNIVERSITE | SU-SCIENCES | UNIV-PARIS | SU-TI
Citation
Jérémy Gauthier, Hélène Boulain, Joke J.F.A. van Vugt, Lyam Baudry, Emma Persyn, et al.. Chromosomal resolution reveals symbiotic virus colonization of parasitic wasp genomes. 2020. ⟨hal-03090838⟩
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