A gene-based map of the Nod factor-independent Aeschynomene evenia sheds new light on the evolution of nodulation and legume genomes

Clémence Chaintreuil; Ronan Rivallan; David Bertioli; Christophe Klopp; Jerome Gouzy; Brigitte Courtois; Philippe Leleux; Guillaume Martin; Jean-Francois Rami; Djamel Gully; Hugues Parrinello; Dany Séverac; Delphine Patrel; Joël Fardoux; William Ribière; Marc Boursot; Fabienne Cartieaux; Pierre Czernic; Pascal Ratet; Pierre Mournet; Eric Giraud; Jean-François Arrighi

doi:10.1093/dnares/dsw020

Home
Submit
Browse
Search
Documentation
- HAL documentation
- Digital deposited work
My tools
OA in practice

A gene-based map of the Nod factor-independent Aeschynomene evenia sheds new light on the evolution of nodulation and legume genomes

Clémence Chaintreuil ¹ Ronan Rivallan ² David Bertioli Christophe Klopp ³ Jerome Gouzy ⁴ Brigitte Courtois ² Philippe Leleux ⁵ Guillaume Martin Jean-Francois Rami ² Djamel Gully ¹ Hugues Parrinello ⁶ Dany Séverac ⁶ Delphine Patrel ¹ Joël Fardoux ¹ William Ribière Marc Boursot Fabienne Cartieaux ¹ Pierre Czernic ¹ Pascal Ratet ⁷ Pierre Mournet ⁸ Eric Giraud ⁹ Jean-François Arrighi ¹

1 UMR LSTM - Laboratoire des symbioses tropicales et méditerranéennes

2 UMR AGAP - Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales

3 UBIA - Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle de Toulouse [Castanet-Tolosan]

4 LIPM - Laboratoire des interactions plantes micro-organismes

5 IBC - Institut de Biologie Computationnelle

6 IGF MGX - Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier GenomiX

IGF - Institut de Génomique Fonctionnelle

7 ISV - Institut des sciences du végétal

8 UMR DAP - Développement et amélioration des plantes

9 CRRM - Centre de recherche rétrospective de Marseille

Clémence Chaintreuil ¹ AuthorId : 371983
Author

Ronan Rivallan ² AuthorId : 1287655

Author

David Bertioli AuthorId : 11497446
Author

Christophe Klopp ³ AuthorId : 359743
Author

Jerome Gouzy ⁴ AuthorId : 1423098

Author IdHAL : jerome-gouzy ORCID : https://orcid.org/0000-0001-5695-4557

Brigitte Courtois ² AuthorId : 313265
Author

Philippe Leleux ⁵ AuthorId : 1213645

Author IdHAL : philippe-leleux ORCID : https://orcid.org/0000-0002-3760-4698

Guillaume Martin AuthorId : 11349549

Author IdHAL : guillaume-martin

Jean-Francois Rami ² AuthorId : 1356822
Author

Djamel Gully ¹ AuthorId : 881679
Author

Hugues Parrinello ⁶ AuthorId : 503589
Author

Dany Séverac ⁶ AuthorId : 1494648
Author

Delphine Patrel ¹ AuthorId : 881678
Author

Joël Fardoux ¹ AuthorId : 1236868
Author

William Ribière AuthorId : 11697835
Author

Marc Boursot AuthorId : 881618
Author

Fabienne Cartieaux ¹ AuthorId : 184854
Author

Pierre Czernic ¹ AuthorId : 158031
Author

Pascal Ratet ⁷ AuthorId : 83963
Author

Pierre Mournet ⁸ AuthorId : 1229653

Author

Eric Giraud ⁹ AuthorId : 184848
Author

Jean-François Arrighi ¹ AuthorId : 881617
Author

1 UMR LSTM - Laboratoire des symbioses tropicales et méditerranéennes (TA A82/J - Campus international de Baillarguet 34398 Montpellier Cedex 5, France - France) StructId : 12770

Cirad - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement : UMR82-2011 (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France) StructId : 11574
UM1 - Université Montpellier 1 (5, boulevard Henri IV - CS 19044 - 34967 Montpellier cedex - France) StructId : 42570
IRD - Institut de Recherche pour le Développement (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France) StructId : 67872
INRA - Institut National de la Recherche Agronomique (France) StructId : 92114
UM2 - Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (Place Eugène Bataillon - 34095 Montpellier cedex 5 - France) StructId : 92690
UM - Université de Montpellier (163 rue Auguste Broussonnet - 34090 Montpellier - France) StructId : 410122
Montpellier SupAgro - Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (2, place Viala 34060 Montpellier Cédex 2 - France) StructId : 474617

2 UMR AGAP - Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (TA A-108 / 03 - Avenue Agropolis - 34398 Montpellier Cedex 5 France - France) StructId : 192475

Montpellier SupAgro - Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (2, place Pierre Viala - 34060 Montpellier Cedex 02 - France) StructId : 92699
Cirad - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement : UMR108-2011 (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France) StructId : 11574
Montpellier SupAgro - Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (2, place Viala 34060 Montpellier Cédex 2 - France) StructId : 474617
INRA - Institut National de la Recherche Agronomique (France) StructId : 92114

3 UBIA - Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle de Toulouse [Castanet-Tolosan] (24 Chemin de Borde Rouge BP 52627 - 31326 Castanet-Tolosan Cedex - France) StructId : 203362

INRA - Institut National de la Recherche Agronomique (France) StructId : 92114
Plateforme bioinformatique du GIS GENOTOUL - Génopole Toulouse Midi-Pyrénées (France) StructId : 349804

4 LIPM - Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (Chemin de Borde-Rouge - BP 27 31326 CASTANET TOLOSAN CEDEX - France) StructId : 530

INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : UMR441 (France) StructId : 92114
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR2594 (France) StructId : 441569

5 IBC - Institut de Biologie Computationnelle (95 rue de la Galéra, 34095 Montpellier - France) StructId : 213159

INRA - Institut National de la Recherche Agronomique (France) StructId : 92114
Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
UM - Université de Montpellier (163 rue Auguste Broussonnet - 34090 Montpellier - France) StructId : 410122
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique (France) StructId : 441569

6 IGF MGX - Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier GenomiX (141, rue de la Cardonille - 34094 Montpellier Cedex 5 - France) StructId : 131811

IGF - Institut de Génomique Fonctionnelle (141, Rue de la Cardonille 34094 Montpellier cedex 5 - France) StructId : 2001
- UM - Université de Montpellier (163 rue Auguste Broussonnet - 34090 Montpellier - France) StructId : 410122
- UM1 - Université Montpellier 1 (5, boulevard Henri IV - CS 19044 - 34967 Montpellier cedex - France) StructId : 42570
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1191 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623
- UM2 - Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (Place Eugène Bataillon - 34095 Montpellier cedex 5 - France) StructId : 92690
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5203 (France) StructId : 441569

7 ISV - Institut des sciences du végétal (bat. 23 Av de la terrasse 91198 GIF SUR YVETTE CEDEX - France) StructId : 442

CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UPR2355 (France) StructId : 441569

8 UMR DAP - Développement et amélioration des plantes (Agro M 2 place Viala 34060 Montpellier Cedex 1 pour le Cirad TA A-108 / 03 - Avenue Agropolis - 34398 Montpellier Cedex 5 - France) StructId : 31879

CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique (France) StructId : 441569
UM2 - Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (Place Eugène Bataillon - 34095 Montpellier cedex 5 - France) StructId : 92690
INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : UMR1098 (France) StructId : 92114
Cirad - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement : UMR96 (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France) StructId : 11574

9 CRRM - Centre de recherche rétrospective de Marseille (Faculté de St Jérôme - Marseille France - France) StructId : 237884

Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3 (3, avenue Robert Schumann - 13628 Aix-en-Provence cedex 1 - France) StructId : 27501

Document type :

Journal articles

Domain :

Life Sciences [q-bio]

Life Sciences [q-bio] / Vegetal Biology

Complete list of metadatas

https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-02410329
Contributor : Pascal Ratet <>
Submitted on : Friday, December 13, 2019 - 6:05:55 PM
Last modification on : Tuesday, February 11, 2020 - 10:10:41 AM

Links full text

Identifiers

HAL Id : hal-02410329, version 1
DOI : 10.1093/dnares/dsw020

Collections

Citation

Clémence Chaintreuil, Ronan Rivallan, David Bertioli, Christophe Klopp, Jerome Gouzy, et al.. A gene-based map of the Nod factor-independent Aeschynomene evenia sheds new light on the evolution of nodulation and legume genomes. DNA Research, Oxford University Press (OUP), 2016, 23 (4), pp.365-376. ⟨10.1093/dnares/dsw020⟩. ⟨hal-02410329⟩

HAL-CNRS

A gene-based map of the Nod factor-independent Aeschynomene evenia sheds new light on the evolution of nodulation and legume genomes

Links full text

Identifiers

Collections

Citation

Export

Metrics

31

Contact

Informations

HAL-CNRS

A gene-based map of the Nod factor-independent Aeschynomene evenia sheds new light on the evolution of nodulation and legume genomes

Links full text

Identifiers

Collections

Citation

Export

Share

Metrics

31

Contact

Informations